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FEMS微生物学生态学旨在确保高质量论文的高效发表,这些论文是原创的,并为理解微生物生态学提供重要贡献。该期刊包含了关于自然土壤、水生和大气生境 (包括极端环境) 以及人工或管理环境中微生物生态基本方面的研究文章和小型评论。关于纯培养以及植物病理学和医学、食品或兽医微生物学领域的研究论文将发表,这些论文将提供有关微生物生态学的有价值的一般信息。论文可以处理任何类型微生物的可培养和不可培养形式: 细菌、古菌、丝状真菌、酵母菌、原生动物、蓝藻、藻类或病毒。此外,该杂志还将发表观点、当前观点和争议文章、评论和给编辑的关于微生物生态学主题的信件。-生态学理论在微生物生态学中的应用-相互作用和信号微生物及其与动植物的相互作用-微生物及其物理化学环境-生物地球化学循环和过程的微生物方面-微生物群落生态学-微生物群落的系统发育和功能多样性-微生物的进化生物学